Bioinformatik
Tobias Straub
Bioinformatik Core Facility
© J. Greune / LMU
Seit mehr als zehn Jahren unterstützt die Bioinformatik-Zentraleinrichtung die Forschung am Biomedizinischen Zentrum (BMC) und darüber hinaus mit zuverlässiger, schneller und praxisorientierter computergestützter Datenanalyse. Die Einrichtung verbindet langjährige Expertise in den Bereichen funktionelle Genomik, Proteomik, Bildanalyse und Biostatistik mit einem effizienten, kooperativen Arbeitsablauf. Projekte können schnell initiiert werden, die Kommunikation ist unkompliziert, und in jeder Phase einer Studie steht eine Beratung zur Verfügung. Der Zugang zu einer modernen Hochleistungsrechnerumgebung (HPC) gewährleistet eine schnelle Verarbeitung selbst bei umfangreichen Datensätzen.
LLM-Integration
Die Einrichtung sammelt aktiv Erfahrungen mit der Integration großer Sprachmodelle in Workflows zur Datenvor- und -nachbearbeitung. Wir teilen Erkenntnisse, diskutieren Möglichkeiten und Grenzen und bieten Forschungsgruppen, die eine LLM-basierte Unterstützung für ihre Analysen evaluieren, Beratung an.
Unser Ziel
Wir möchten Forschern zuverlässige, hochwertige rechnergestützte Unterstützung zur Verfügung stellen, die wissenschaftliche Entdeckungen beschleunigt und die datengestützte Forschung am BMC und darüber hinaus stärkt.
Was wir anbieten
Leitlinien zur Versuchsplanung, zu Strategien der Datenanalyse und zur Projektplanung, um zuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse zu gewährleisten.
Praktische Unterstützung im Bereich Bioinformatik für Forschungsgruppen, von der ersten Datenverarbeitung bis hin zu fortgeschrittener Modellierung und Auswertung.
Zentralisierte Bioinformatik-Dienste für koordinierte Forschungskonsortien, die einheitliche Analyseabläufe und gemeinsame Standards ermöglichen.
Bei Projekten mit hohem Rechenaufwand arbeitet ein fest zugeordneter Mitarbeiter der Einrichtung eng mit der Forschungsgruppe zusammen und führt unter deren Aufsicht Analysen durch, wodurch Kontinuität, Effizienz und methodische Konsistenz gewährleistet werden.
a) Kurse in Biostatistik für Institute, Netzwerke und Promotionsprogramme.
b) Kurzzeitige individuelle Fortbildungsmöglichkeiten und Betreuung kleiner Projekte für Studierende, Postdocs und Projektleiter (je nach Verfügbarkeit).
Zugang zu einem Hochleistungs-Rechencluster (HPC), der für bioinformatische Arbeitslasten optimiert ist, darunter groß angelegte Sequenzierungen und Multi-Omics-Analysen.
Forschern zuverlässige und hochwertige rechnergestützte Unterstützung zur Verfügung zu stellen, die wissenschaftliche Entdeckungen beschleunigt und die datengestützte Forschung am BMC und darüber hinaus stärkt.
Kontakt
Core Facility Bioinformatik
Biomedizinisches Centrum (BMC)
LMU Medizin, LMU München
Großhadernerstr. 9
D-82152 Planegg-Martinsried
Telefonnummer: +49 (0)89 2180 75 439